La contabilidad electrónica exige que el sistema pueda estructurar información contable conforme a los requerimientos aplicables. El control interno debe separar ingresos, egresos, impuestos, CFDI relacionados y cuentas contables.
Despacho Total incorpora una capa operativa para el contador; los procesos especializados de generación de archivos fiscales pueden ampliarse mediante módulos o servicios conectados.